Caspase 3

Caspase 3
Imagine ilustrativă a articolului Caspase 3
Caspaza 3 umană complexată cu un inhibitor de fenilpropil cetonă ( PDB  1RHK )
Caracteristici principale
Simbol CASP3
Nr. CE 3.4.22.56
Homo sapiens
Locus 4 q 35.1
Greutate moleculară 31 608  Da
Număr de reziduuri 277  aminoacizi
Linkuri accesibile din GeneCards și HUGO .
Intra 836
HUGO 1504
OMIM 600636
UniProt P42574
RefSeq ( ARNm ) NM_032991.2, XM_011532301.1 NM_004346.3, NM_032991.2, XM_011532301.1
RefSeq ( proteină ) NP_116786.1, XP_011530603.1 NP_004337.2, NP_116786.1, XP_011530603.1
Împreună ENSG00000164305
PDB 1CP3 , 1GFW , 1I3O , 1NME , 1NMQ , 1NMS , 1PAU , 1QX3 , 1RE1 , 1RHJ , 1RHK , 1RHM , 1RHQ , 1RHR , 1RHU , 2C1E , 2C2K , 2C2M , 2C2O , 2CDR , 2CJX , 2CJY , 2CNK , 2CNL , 2CNN , 2CNO , 2DKO , 2H5I , 2H5J , 2H65 , 2J30 , 2J31 , 2J32 , 2J33 , 2XYG , 2XYH , 2XYP , 2XZD , 2XZT , 2Y0B , 3DEH , 3DEI , 3DEJ , 3DEK , 3EDQ , 3GJQ , 3GJR , 3GJS , 3GJT , 3H0E , 3ITN , 3KJF , 3PCX , 3PD0 , 3PD1 , 4DCJ , 4DCO , 4DCP , 4EHA , 4EHD , 4EHF , 4EHH , 4EHK , 4EHL , 4EHN , 4JJE , 4JQY , 4JQZ , 4JR0 , 4PRY , 4PS0 , 4QTX , 4QTY , 4QU0 , 4QU5 , 4QU8 , 4QU9 , 4QUA , 4QUB , 4QUD , 4QUE , 4QUG , 4QUH , 4QUI , 4QUJ , 4QUL

GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega

Caspase 3 Date esentiale
Nr. CE EC 3.4.22.56
numar CAS 169592-56-7
Activitatea enzimatică
IUBMB Intrare IUBMB
IntEnz Vizualizare IntEnz
BRENDA Intrarea BRENDA
KEGG Intrare KEGG
MetaCyc Calea metabolică
PRIAM Profil
PDB Structuri

Caspazei 3 este o cistein protează familie de caspazelor (engl c -dependente ysteine ASP direcționate artate prote ases , care interacționează cu caspaza 8 și caspaza 9 . Este codat în om prin gena CASP3 , localizată pe cromozomul 4 . Orthologous gena CASP3 au fost identificate într-un număr mare de mamifere pentru care sunt disponibile date genomice cuprinzătoare. Au fost găsiți și ortologi specifici printre păsări , șopârle , lisamfibieni și teleost .

Caspaza 3 este similar cu caspaza 7 , în măsura în care scindează din lanțurile polipeptidice la secvența Asp - Xaa - Xaa - Asp - | -: acesta din urmă reziduu aspartat este esențială pentru enzimă , în timp ce primul reziduu aspartat, N- terminale partea secvenței, în unele cazuri poate lipsi; al doilea reziduu este în general hidrofil și al treilea este destul de hidrofob , deși secvențele Asp - Ala - Xaa - Asp - | - și Asp - Val - Xaa - Asp - | - sunt, de asemenea, clivate. Specificitatea caspazelor pentru substraturile lor a fost larg exploatată în proiectarea inhibitorilor și a medicamentelor caspazei .

Caspase 3 are multe trăsături comune tuturor caspazelor cunoscute în prezent. Situl său activ are reziduuri de cisteină 163 și histidină 121 care asigură specificitatea clivării legăturii peptidice pe carboxilul lateral al motivului reziduului aspartat caracteristic patru aminoacizi Asp - Xaa - Xaa - Asp - | -. Această specificitate permite caspazelor să fie deosebit de selective, fiind de 20.000 de ori mai active în prezența aspartatului decât în ​​prezența glutamatului . Caspazele sunt prezente în celule ca proenzime numite procaspaze, care conțin o subunitate mare N -terminală 20  kDa urmată de o subunitate mică de 10  kDa .

Activarea secvențială a caspazelor joacă un rol central în declanșarea apoptozei celulare . Procaspazele sunt inactive până când suferă un proces proteolitic la resturile de aspartat conservate eliberând cele două subunități , mari și mici, care se dimerizează pentru a forma enzima activă. Această proteină clivează și activează caspaza 6 și caspaza 7 , în timp ce ea însăși este modificată și activată de caspaza 8 , caspaza 9 și caspaza 10 .

Note și referințe

  2. Valorile pentru masa și numărul de resturi indicate aici sunt cele ale precursorului de proteină care rezultă din traducerea a genei , inainte de modificări post-translaționale și pot diferi în mod semnificativ de valorile corespunzătoare pentru proteine funcționale.
  3. (în) Emad S. Alnemri David J. Livingston, Donald W. Nicholson, Guy Salvesen, Nancy A. Thornberry Winnie W. Wong, Junying Yuan , "  Human ICE / CED-3 protease nomenclature  " , Cell , vol.  87 n o  2, 18 octombrie 1996, p.  171 ( PMID  8861900 , DOI  10.1016 / S0092-8674 (00) 81334-3 , citiți online )
  4. (în) Johnson Agniswamy, Bin Fang și Irene T. Weber , „  Plasticitatea buzunarelor de specificitate S2-S4 ale călăului caspase-7 Revelat prin analize structurale și cinetice  ” , FEBS Journal , vol.  274, nr .  18, septembrie 2007, p.  4752-4765 ( PMID  17697120 , DOI  10.1111 / j.1742-4658.2007.05994.x , citiți online )
  5. (în) Bin Fang, Peter I. Boross Jozsef Tozser și Irene T. Weber , "  Structural and Kinetic Analysis of Caspase-3 Reveals Role for S5 Binding Site in Substrate Recognition  " , Journal of Molecular Biology , vol.  360, n o  3, 14 iulie 2006, p.  654-666 ( PMID  16781734 , DOI  10.1016 / j.jmb.2006.05.041 , citiți online )
  6. (în) Irene T. Weber, Bin Fang și Johnson Agniswamy , "  Caspases: Structured-Guided Design of Drugs to Control Cell Death  " , Mini-Reviews in Medicinal Chemistry , Vol.  8, n o  11, octombrie 2008, p.  1154-1162 ( PMID  18855730 , DOI  10.2174 / 138955708785909899 , citiți on - line )
  7. (în) Andrew H. Wyllie , "  Apoptoza: o privire de ansamblu  " , British Medical Bulletin , Vol.  53, n o  3, 1997, p.  451-465 ( PMID  9374030 , citiți online )
  8. (în) David K. Perry, Miriam J. Smyth, R. Henning Stennicke, Guy S. Salvesen, Patrick Duriez, Guy G. Poirier și Yusuf A. Hannun , "  Zincul este un inhibitor puternic al proteazei apoptotice caspaza 3. O țintă nouă pentru zinc în inhibarea apoptozei  ” , Journal of Biological Chemistry , vol.  272, nr .  30, 25 iulie 1997, p.  18530-18533 ( PMID  9228015 , DOI  10.1074 / jbc.272.30.18530 , citiți online )
  9. (în) Henning R. Stennicke Martin Renatus Morten Meldal și Guy S. Salvesen , „  substraturile fluorescente peptidice stinse intern dezvăluie preferințele subsite ale caspazei umane-1, 3, 6, 7 și 8  ” , Biochemical Journal , vol.  350, n o  Pt 2, Septembrie 2000, p.  563-568 ( PMID  10947972 , PMCID  1221285 , DOI  10.1042 / 0264-6021: 3500563 , citiți online )
  10. (în) Guy S. Salvesen , "  Caspases: deschiderea cutiilor și interpretarea săgeților  " , Cell Death & Differentiation , vol.  9, n o  1, ianuarie 2002, p.  3-5 ( PMID  11803369 , DOI  10.1038 / sj / cdd / 4400963 , citiți online )
  11. (în) Heather A. Harrington, Kenneth L. Ho, Samik Ghosh și KC Tung , "  Construcția și analiza unui model modular de activare a caspazei în apoptoză  " , Biologie teoretică și modelare medicală , Vol.  5, 10 decembrie 2008, p.  26 ( PMID  19077196 , PMCID  2672941 , DOI  10.1186 / 1742-4682-5-26 , citiți online )