Ensembl este un sistem bioinformatic pentru adnotarea automată a genomului . Este un proiect comun al Institutului European de Bioinformatică (EBI) și al Institutului Wellcome Trust Sanger a cărui idee centrală este de a organiza câmpuri vaste de informații biologice în jurul secvențelor genomice .
Pentru fiecare genom analizat, Ensembl încearcă să identifice printr-un proces automat toate genele pe care le conține. Pentru a face acest lucru, se bazează pe date din secvențe existente ( ARN , proteine ), pe care le „închide” pe genom, pentru a deduce structura genelor.
Pe acest prim strat de adnotare, cel al structurii genelor, Ensembl va adăuga alte elemente, printre care:
Ensembl se prezintă mai întâi ca un „genom browser” ( „ Genome Browser ” ) pentru a explora și vizualiza diferite niveluri genomul multor organisme.
Ensembl este, de asemenea, o bază de date deschisă din care se poate trage în mod liber, fie direct, fie printr-o interfață de programare , fie prin sistemul de interogare BioMart.
În cele din urmă, Ensembl este o infrastructură software deschisă care face posibilă construirea diferitelor sisteme de organizare a datelor legate de secvențe genomice.
Proiectul Ensembl este condus de o cultură a deschiderii extinse, care se traduce prin: