Virușii ARN

Virușii ARN Descrierea acestei imagini, comentată și mai jos Reprezentarea virusului gripal Clasificare
Tip Virus

Regatul

Riboviria
ICTV

Grupuri de rang inferior

Un virus ARN , numit uneori ribovirus , este un virus al cărui material genetic este format din ARN . Acest acid nucleic este, în general , monocatenar ( ssARN ), dar poate fi, de asemenea , bicatenar ( dsARN ). Virusii ARN pot provoca diverse boli umane , cum ar fi boala virusului Ebola , SARS , gripa , hepatita C , febra West Nile , poliomielita , rujeola sau chiar COVID-19 .

Comitetul International privind taxonomie a Virușii (Comitetul International privind taxonomia a virusurilor - ICTV ) aranjează - le în grupele III , IV și V ale clasificării Baltimore .

Cu toate acestea, ICTV se încadrează în grupul VI al retrovirusului și le consideră virusuri ARN distincte, viruși al căror material genetic constă din ARN, dar al căror ciclu de viață implică o transcriere inversă în ADN  : HIV este un exemplu.

Prima secvențiere a unei gene și apoi a genomului unui virus ARN a fost efectuată în 1976 de către o echipă din Gent pe bacteriofagul MS2. Virușii ARN prezintă rate de mutație foarte mari, spre deosebire de virușii ADN  : replicarea este sensibilă la erori, iar acești viruși nu au ADN polimeraze care să permită detectarea și corectarea acestor erori, deci formează mai mult sau mai puțin virulente.

Caracteristici

Viruși ARN monocatenari

Virușii ARN pot fi, de asemenea, clasificați, în funcție de polaritatea ARN-ului lor, în viruși cu polaritate negativă (antisens), polaritate pozitivă (sens) sau polaritate dublă (ambisens). ARN-ul cu polaritate pozitivă este identic cu cel al ARN-urilor messenger virale , astfel încât ARN-ul viral poate fi tradus imediat de către celula gazdă . Un ARN viral antisens este complementar cu ARN mesager și, prin urmare, trebuie convertit în ARN de sens de către o ARN polimerază dependentă de ARN pentru a putea fi tradusă în proteine . Ca atare, ARN-ul purificat de la un virus ARN cu polaritate pozitivă poate provoca direct infecții, deși poate fi mai puțin infecțios decât întregul virus. ARN "antisens" purificat de la un virus nu este infecțios de la sine, deoarece trebuie mai întâi transcris în ARN cu polaritate pozitivă, dar fiecare virion poate fi transcris ca ARN cu polaritate pozitivă sau negativă. Virușii ARN ambisens seamănă cu virușii ARN antisens, cu excepția faptului că transcriu și gene din catena de sens.

Virusul ARN bicatenar

Virușii ARN bicatenari sunt un grup eterogen de viruși distribuiți pe scară largă într-o varietate de gazde ( oameni , animale , plante , ciuperci și bacterii ), al căror genom are un număr variabil de segmente (de la unu la doisprezece) a căror geometrie a capsidei este de asemenea, foarte variabil. Membrii acestui grup includ rotavirusurile , cunoscute la nivel mondial ca fiind cea mai frecventă cauză de gastroenterită la copii mici și virusul febrei catarale ovine , un agent patogen care afectează bovinele și animalele.oine cu consecințe economice semnificative. În ultimii ani, s-au înregistrat progrese remarcabile în determinarea, la nivel atomic și subnanometric, a structurii unui număr de proteine virale cheie care constituie capsidul virional al mai multor viruși ARN dublu catenar, evidențiind paralele importante în structura și procesele de replicare ale mulți dintre acești viruși.

Rata mutației

Virușii ARN au, în general, o rată de mutație ridicată, în absența ADN polimerazei capabile să repereze și să corecteze erorile și, prin urmare, sunt incapabili să repare ARN-ul materialului genetic deteriorat. De virusuri ADN au o rată semnificativ mai mică mutație datorită ADN polimerazele capacitatea de corecție fără intervenția celulei gazdă. De Retrovirusurile au o rată mare de mutație, chiar dacă ADN - ul lor se integrează intermediare în genomul gazdei (și , prin urmare , sub rezerva de a reda, odată integrat în ADN - ul gazdei), deoarece erorile de transcriere inversă sunt integrate în cele două catene ale ADN - ului înainte de formarea acestora .

Deși ARN-ul mută în general rapid, lucrările recente au arătat că virusul SARS și virusurile ARN aferente conțin un genom care mută foarte lent decât s-ar fi așteptat dacă mutațiile nu ar fi controlate deloc. Genomul în cauză are o structură tridimensională complexă despre care se crede că oferă o funcție chimică necesară răspândirii virale, posibil ca o ribozimă . Deci, majoritatea mutațiilor ar face-o nepotrivită în acest scop și ar împiedica răspândirea lor.

Replicare

Virușii ARN la animale sunt clasificați în trei grupuri distincte pe baza genomului și a modului de replicare (din grupul lor din vechea clasificare Baltimore ):

Grupa III: Virus ARN dublu catenar (ARNd)

Sursă.

Grupa IV: virusul ARN monocatenar cu polaritate pozitivă ((+) ssRNA)

Sursă.

Grupa V  : virus ARN monocatenar cu polaritate negativă ((-) ssRNA)

Sursă.

Vezi și tu

Referințe

  1. (în) „  Taxonomia virusului: lansarea 2018b  ” , ICTV , iulie 2018(accesat la 4 iulie 2019 ) .
  2. (în) Patton JT (editor). ( Traducere în  daneză), virusuri ARN bicatenare segmentate: structură și biologie moleculară , Norfolk, Caister Academic Press, 2008, 373  p. ( ISBN  978-1-904455-21-9 , LCCN  2008371444 , citit online )
  3. (în) W. Fiers, R. Contreras, F. Duerinck, Haegeman G., D. Iserentant J. Merregaert W. Min Jou, F. Molemans, A. Raeymaekers A. Van den Berghe, G. Volckaert și M. Ysebaert , „  Secvența nucleotidică completă a ARN-ului bacteriofag MS2: structura primară și secundară a genei replicazei  ” , Nature , vol.  260, nr .  5551, 8 aprilie 1976, p.  500-507 ( PMID  1264203 , DOI  10.1038 / 260500a0 , Bibcode  1976Natur.260..500F , citiți online )
  4. Despre acest subiect, vezi și Retrovirus .
  5. (în) Mary Nguyen și Anne-Lise Haenni , „  Expression of strategies ambisense viruses  ” , Virus Research , vol.  93, n o  2 Iunie 2003, p.  141-150 ( PMID  12782362 , DOI  10.1016 / S0168-1702 (03) 00094-7 , citiți online )
  6. (în) Roy P ( trad.  , Daneză) Virusuri animale: biologie moleculară , Norfolk, Caister Academic Press,2008, 531  p. ( ISBN  978-1-904455-22-6 , LCCN  2008353533 , citește online ) , „Disecția moleculară a virusului limbii albastre”.
  7. (în) (P Roy . Trad  Daneză) Virusuri ARN bicatenare segmentate: structură și biologie moleculară , Norfolk, Caister Academic Press,2008, 373  p. ( ISBN  978-1-904455-21-9 , LCCN  2008371444 , citit online ) , „Structura și funcția virusului febrei catarale ovine și a proteinelor sale”.
  8. (ro) Klein, Donald W .; Prescott, Lansing M .; Harley, John ( trad.  Din daneză), Microbiologie , Dubuque, Iowa, Wm. C. Brown, 1993, A 2 -a  ed. ( ISBN  978-0-697-01372-9 ).
  9. (în) Michael P Robertson, Haller Igel, Robert Baertsch David Haussler, Manuel Ares Jr. și William G Scott , „  Structura unui element de ARN conservat riguros în genomul virusului SARS  ” , PLoS Biology , vol.  3, n o  1, ianuarie 2005, e5 ( PMID  15630477 , PMCID  539059 , DOI  10.1371 / journal.pbio.0030005 , citiți online )
  10. (în) Michael J. Adams, John F. Antoniw și Jan Kreuze , virgaviridae o nouă familie de viruși vegetali în formă de tijă  " , Archives of Virology , vol.  154, nr .  12, decembrie 2009, p.  1967-1972 ( PMID  19862474 , DOI  10.1007 / s00705-009-0506-6 , citiți online )
  11. (în) Kathie A. Mihindukulasuriya, L. Nguyen Nang, Guang Wu, Henry V. Huang, Amelia PA Travassos da Rosa L. Vsevolod Popov, Robert B. Tesh și David Wang , „  Nyamanini și Midway Viruses Define a Novel Taxa of Virușii ARN în ordinea Mononegavirales  ” , Revista de virologie , vol.  83, nr .  10, Mai 2009, p.  5109-5116 ( PMID  19279111 , PMCID  2682064 , DOI  10.1128 / JVI.02667-08 , citiți online )

linkuri externe