APC (proteină)
| Polenoză adenomatoasă Coli | ||
 Superhélice N aminoterminal CPA uman ( PPB 1DEB ) | ||
| Caracteristici principale | ||
|---|---|---|
| Numele aprobat | APC, regulator al căii de semnalizare WNT | |
| Simbol | APC | |
| Sinonime | Proteina fosfataza 1, subunitatea de reglementare 46 | |
| Homo sapiens | ||
| Locus | 5 q 22.2 | |
| Greutate moleculară | 311 646 Da | |
| Număr de reziduuri | 2.843 aminoacizi | |
| Intra | 324 | |
| HUGO | 583 | |
| OMIM | 611731 | |
| UniProt | P25054 | |
| RefSeq ( ARNm ) | NM_000038.5 , NM_001127510.2 | |
| RefSeq ( proteină ) | NP_000029.2 , NP_001120982.1 | |
| Împreună | ENSG00000134982 | |
| PDB | 1DEB , 1EMU , 1JPP , 1M5I , 1T08 , 1TH1 , 1V18 , 2RQU , 3AU3 , 3NMW , 3NMX , 3NMZ , 3QHE , 3RL7 , 3RL8 , 3T7U , 4G69 , 4YJE , 4YJL , 4YK6 | |
|
GENATLAS • GeneTests • GoPubmed • HCOP • H-InvDB • Treefam • Vega | ||
| Linkuri accesibile din GeneCards și HUGO . | ||
Proteina APC , din limba engleză polipoză adenomatoasă coli , este o molecula care regleaza concentratia de β-cateninei , care acționează cu caderina E , care este implicată în adeziunea celulară . La om , este codificată de gena APC , situată pe cromozomul 5 . Cunoaștem ortologii la toate mamiferele pentru care sunt disponibile date genomice cuprinzătoare. De mutații ale acestei gene poate duce la cancer de colon .
APC este o genă supresoare tumorale . Genele de acest tip previn proliferarea necontrolată a celulelor , care se poate dezvolta în cancer . Proteina care rezultă din expresia acestei gene joaca un rol determinant în mai multe procese celulare care pot duce la o tumoare . Permite controlul frecvenței mitozei , a modului în care o celulă aderă la vecinii săi dintr-un țesut biologic , dobândirea de către o celulă a polarității sale, morfogeneza structurilor tridimensionale sau chiar mișcarea unei celule în interiorul sau în exteriorul unei țesături. De asemenea, ajută la asigurarea corectă a numărului de cromozomi produși prin divizarea celulară . Acesta îndeplinește aceste diferite funcții în esență prin asocierea cu alte proteine, în special cu cele implicate în aderență și semnalizare celulară . În special, controlează activitatea β-cateninei, prin intermediul proteinelor Wnt . Reglarea β-cateninei previne activarea prea frecventă a genelor care stimulează diviziunea celulară, precum și creșterea excesivă a celulelor.
Implicarea în anumite tipuri de cancer
Cea mai frecventă mutație în cancerul de colon duce la inactivarea proteinei APC. Când astfel de mutații sunt absente, în schimb se observă mutații care activează β-catenina . Mutațiile din proteina APC pot fi congenitale sau pot apărea spontan în celulele somatice , adesea ca urmare a mutațiilor din alte gene care reduc capacitățile de reparare a ADN-ului . Pentru ca cancerul să se dezvolte, ambele alele ale genei trebuie să fie afectate. Mutațiile APC sau β-catenina trebuie să fie urmate de alte mutații pentru a deveni canceroase; cu toate acestea, la persoanele cu mutații care inactivează APC, riscul de a dezvolta cancer de colon la vârsta de 40 de ani este de aproape 100%.
Familia polipoză colorectală provine din mutații congenitale din gena proteinei inactivatoare APC . Majoritatea acestor mutații produc o proteină APC anormal de scurtă, probabil nefuncțională. Această proteină trunchiată nu împiedică dezvoltarea excesivă a țesuturilor care duce la formarea polipilor , care se pot dezvolta în cancer . Cea mai frecventă mutație în polipoza colonică familială este ștergerea a cinci baze din gena APC . Proteină rezultată secvența este modificată de reziduuri 1309.
Un alt tip de mutații, care afectează aproximativ 6% dintre persoanele de origine ashkenazi , constă în înlocuirea reziduului de izoleucină din poziția 1307 cu un reziduu de lizină , notat I1307K. Clasificat inițial ca neavând nicio incidență, se dovedește că ar crește riscul de a dezvolta cancer de colon.
Structura
Proteina umană completă are 2843 reziduuri de aminoacizi la o masă moleculară de 311,6 kDa . Structura tridimensională a domeniului N- terminal al mai multor dintre aceste proteine a fost elucidată la rezoluție înaltă. Cea mai mare parte a proteinei pare dezordonată, dar nu se știe dacă această regiune mare, fără structură notabilă observată in vitro , care cuprinde reziduurile de la 800 la 2843, rămâne in vivo sau este stabilizată acolo de proteine necunoscute care ar interacționa cu ea. De asemenea, s-a demonstrat că regiunea care concentrează mutațiile în jurul centrului proteinei este intrinsec dezordonată in vitro .
Note și referințe
- (în) Catherine L. Daya și Tom Alber , " Structura cristalină a domeniului amino-terminal înfășurat în spirală al supresorului tumoral APC " , Journal of Molecular Biology , vol. 301, n o 1, 4 august 2000, p. 147-156 ( PMID 10926498 , DOI 10.1006 / jmbi.2000.3895 , citiți online )
- Valorile pentru masa și numărul de resturi indicate aici sunt cele ale precursorului de proteină care rezultă din traducerea a genei , inainte de modificări post-translaționale și pot diferi în mod semnificativ de valorile corespunzătoare pentru proteine funcționale.
- (în) I. Nishisho, Y. Nakamura, Y. Miyoshi, Y. Miki, H. Ando, A. Horii, K. Koyama, J. Utsunomiya, Baba S. și P. Hedge , „ Mutațiile genelor cromozomului 5q21 la pacienții cu FAP și cancer colorectal ” , Știință , vol. 253, nr . 5020, 9 august 1991, p. 665-669 ( PMID 1651563 , DOI 10.1126 / science.1651563 , citiți online )
- (în) Sanford D. Markowitz și Monica M. Bertagnolli , „ Bazele moleculare ale cancerului colorectal ” , The New England Journal of Medicine , vol. 361, nr . 25, 17 decembrie 2009, p. 2449-2460 ( PMID 20018966 , PMCID 2843693 , DOI 10.1056 / NEJMra0804588 , citiți online )
- (în) Alyssa C. Lesko, Kathleen H. Goss, Frank F. Yang, Adam Schwertner, Imge Hulur Kenan Onel și Jenifer R. Prosperi , " Supresorul tumorii APC este necesar pentru polarizarea celulelor epiteliale și morfogeneza tridimensională " , Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Molecular Cell Research , vol. 1853 n o 3, martie 2015, p. 711-723 ( PMID 25578398 , PMCID 4327896 , DOI 10.1016 / j.bbamcr.2014.12.036 , citiți online )
- (în) David P. Minde, Zeinab Anvarian Stefan Rüdiger GD și Madelon Maurice , „ Tulburarea încurcată : cum pot duce la apariția mutațiilor în sensul proteinei supresoare tumorale APC? ” , Cancer molecular , vol. 10, 22 august 2011, p. 101 ( PMID 21859464 , PMCID 3170638 , DOI 10.1186 / 1476-4598-10-101 , citiți online )
- (în) „ Extinderea mare a tulburării în polipoză adenomatoasă Coli oferă o strategie pentru a proteja semnalizarea Wnt împotriva mutațiilor punctuale ” , PLoS One , vol. 8, n o 10, 9 octombrie 2013, Articolul n o e77257 ( PMID 24130866 , PMCID 3793970 , DOI 10.1371 / journal.pone.0077257 , citiți on - line )