Domni | Bacterii |
---|---|
Divizia | Proteobacterii |
Clasă | Gammaproteobacterii |
Ordin | Pseudomonadale |
Familie | Pseudomonadaceae |
De Bacteriile din genul Pseudomonas poate fi definit prin:
La începutul anilor 2000, familia Pseudomonaceae era considerată probabil cea mai abundentă și răspândită formă de viață de pe planetă. Acest gen include mai mult de o sută de specii omniprezente (dintre care specia tip este Pseudomonas aeruginosa , denumită în general Bacillus pyocyanis ). Cu toate acestea, acest număr este redus, deoarece progresul filogeneticii face posibilă rafinarea clasificării. Tindem spre șaizeci de specii.
Aceste bacterii, răspândite pe scară largă în mediu, trăiesc în sol și în apă dulce, sărată și sărată, de suprafață și subterană și se găsesc chiar vii pentru anumite tulpini din ceață , în ploaie sau în nori până la peste 10 km altitudine . Se găsesc pe plante, în materie organică non-vie (produse alimentare), ducând uneori la deteriorarea lor organoleptică . Oamenii și-au mărit habitatele, inclusiv prin transportul aerian, maritim și fluvial și în subsol prin fracturare hidraulică, deoarece se găsește și în nămolurile de foraj și fluidele de fracturare .
Se găsesc la oameni sau animale în cavitatea nazală și în intestin. Ele constituie, în cea mai mare parte, o floră comensală .
Unii joacă un rol patogen:
Acestea ocupă diverse nișe ecologice, dar se găsesc mai ales în medii umede, cum ar fi apa dulce, apa de mare, apa termală. Se găsesc în cantități mai mici în apă bogată în materie organică (în special apă stagnantă) ca rezultat al concurenței dintre microorganisme în care Pseudomonas nu este cel mai eficient. În case, acestea se găsesc astfel în sifoane de chiuvetă, apă din rezervoarele de apă de ploaie care, atunci când sunt utilizate pentru udarea plantelor, pot provoca boli la plante, în special la flori (pentru speciile fitopatogene).
Natura foarte omniprezentă a Pseudomonas este legată de capacități de adaptare neobișnuite în bacterii, permițându-le să se adapteze rapid la un număr mare de medii și la condiții de viață dificile; Unele tulpini de pseudomonas aeruginosa se numără printre microbii cunoscuți ca fiind cei mai rezistenți la antibiotice
Multe tulpini de Pseudomonas joacă un rol major în procesele de biodegradare . În procesele de remediere și tratare a siturilor poluate , biodegradarea sau poate fi favorizată sau accelerată de aportul de nutrienți sau de tulpini bacteriene selectate. Acesta este cazul, de exemplu, pentru poluarea solului sau a apei prin păcură sau țiței. În acest caz, însămânțarea cu tulpini mixte de Pseudomonas și Rhodococcus și s-a dovedit a fi mai eficientă în degradarea păcurii într-un mediu acvatic. În acest din urmă caz, nu am reușit să îmbunătățim performanța bacteriilor prin creșterea asocierii la trei, patru sau cinci tulpini de alte bacterii.
Asocierea ciupercilor / bacteriilor este, de asemenea, foarte frecventă pentru degradarea materiei organice sau în anumite procese patogene (superinfecție).
La om, specia Pseudomonas aeruginosa (numită și bacil piocianic) apare frecvent ca agent patogen oportunist . Se găsește în flora de tranzit de pe piele și mucoase și provoacă infecții secundare de răni sau arsuri. La indivizii imunocompromiși poate fi cauza diferitelor infecții cutanate și viscerale sau chiar sepsis . Prezintă un risc deosebit de mare de infecții nosocomiale (contractate prin îngrijire spitalicească), în special cu tulpini rezistente la anumite antibiotice obișnuite.
Ceilalți germeni nu sunt foarte agresivi de la sine, dar se comportă, în general, ca germeni „oportunisti” profitând de condițiile anormale de implantare la indivizii debilitați, creând flora de substituție sau infecții grave prin introducerea accidentală în organism (cateterizare, baxter, sondaje etc.). Rolul lor a căpătat o importanță mai mare în ultimii ani, în special în spitale.
Pseudomonas aeruginosas este sensibil la fluorochinolone și, de obicei, nu are dificultăți în a fi tratat. Cu toate acestea, unele tulpini devin rezistente la antibiotice. Din păcate, datorită naturii lor multirezistente și a utilizării masive de antibiotice , aceste tulpini au fost selectate artificial de oameni și pot ajunge să predomine asupra altora.
Mediul spitalicesc este locul ideal pentru această selecție nedorită, iar Pseudomonas aeruginosa este responsabilă de multe infecții nosocomiale .
Terapia de fagi este utilizat pe oameni , în unele țări , cum ar fi Rusia și Georgia. În Rusia există un cocktail bacteriofag conceput special împotriva Pseudomonas în farmacii .
În Franța, terapia cu fagi este posibilă numai în baza autorizației temporare de utilizare emisă de ANSM. Pherecydes Pharma a dezvoltat un cocktail bacteriofag împotriva P. aeruginosa: P. Aeruginosa PHAGE PP113. Este primul bacteriofag care apare în site-urile franceze de referință la droguri . Este disponibil doar pe ATUn .
Confruntat cu lipsa unei soluții prin circuitul tradițional de îngrijire, au fost înființate organizații de pacienți în Franța pentru a facilita accesul la bacteriofag străin.
Aspect : speciile din genul Pseudomonas sunt bacili gram negativi fini, drepți și foarte mobili datorită unui flagel polar: monotric ciliat, lipsit de spori și capsule.
Gruparea : apar de cele mai multe ori izolate sau în diplobacili.
Speciile din genul Pseudomonas nu sunt germeni foarte pretențioși, marea majoritate a speciilor nu necesită niciun factor de creștere și sunt capabile să utilizeze ca singură sursă de carbon și energie un spectru larg de substraturi carbonice simple și variate.
Se dezvoltă în toate mediile comune, chiar și în cele mai simple. Sunt iubitori de alcaline.
De asemenea, au o toleranță mare în intervalele de temperatură înconjurătoare, deși având o temperatură optimă de creștere între 30 și 35 ° C ( mezofilă ), sunt capabili să se dezvolte la temperaturi cuprinse între 4 și 42 ° C prin încetinirea metabolismului lor . Prin urmare, creșterea lor nu este total împiedicată de încăperile frigorifice și incubatoarele.
Ele sunt rezistente la mulți inhibitori bacterieni, în special agenți chimici. Acestea continuă să se dezvolte în anumite soluții antiseptice (în special cetrimide ) și sunt rezistente la multe antibiotice .
Mijloace de cultură utilizate-1 = negativ sau absență, caracter absent în 100% sau prezent în 0%; 1 = pozitiv sau prezență, trăsătură prezentă în 100% sau absentă în 0%; 0 sau spațiu liber = caracter variabil prezent în 50% sau fără informații
Drăguț | Specii | Subtip / Observații | Oxidaza | 42 ° C ( termofil ) | 4 ° C ( criofil ) | King F (pentru Fluoresceina = Pyoverdine ) | Regele P (pentru piocianină ) | alt Pigment | Poli-beta-hidroxi-butirat | Mobilitate | ADH = L-Arginin Dehidrogenază | NO3 Nitrat reductază (culoare)> Nitriți (roșu) | Gelatinaza = Colagenaza | Amilaza = amidon hidrolaza | Lecitinază = Reacție la gălbenușul de ou | Lipaza (hidroliza Tween80) | NO2> N2 | Catecol orto-clivat | Procathénuate orto-clivaj | Procatenați meta-clivajul | Levan (meta-clivaj) produs din zaharoză | D- Asimilarea glucozei | Asimilarea D-trehaloza | Asimilarea zaharozei | Asimilarea propionatului | Asimilarea butiratului | Asimilarea D-Sorbitol | Asimilarea adonitolului | Asimilarea mezo-inozitolului | Asimilarea geraniolului | Asimilarea L-valină | Asimilarea D-alaninei | Asimilarea L-argininei | Arginina | Hidroliza biliară-esculină = (beta-glucozidază) | Citrat de Simmons | Asimilarea citratului trisodic | D- Fermentarea glucozei | D- Asimilarea glucozei |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Pseudomonas | sp | 0,99 | 0,9 | -0,68 | -1 | -1 | -1 | -0,86 | |||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | aeruginosa | 0,97 | 0,9 | -1 | 0,9 | 0,9 | piomelanină = maro negru sau mahon; piorubină = aeruginosină A = roșu fenazinic | -1 | 0,94 | 0,7 | 0,92 | 0,84 | -0,9 | -0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,98 | -1 | -1 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -1 | -0,9 | 0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,38 | 0,98 | |||
Pseudomonas | fluorescenți | Eu | 0,99 | -1 | 0,98 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 1 | 0,35 | -0,46 | 0,4 | -0,9 | 0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,98 | 1 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,01 | 0,01 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,98 | ||
Pseudomonas | putida | 0,98 | -1 | 0,7 | 0,7 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 1 | 0,76 | -0,94 | -1 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -1 | -0,6 | 0,9 | 0,9 | -0,7 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -1 | 0,98 | -0,8 | 0,9 | |||
Pseudomonas | agarici | fără interes medical, fitopatogen | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | alcaligenele | fără interes medical | 0,97 | 0,9 | -1 | -0,9 | -0,9 | galben-portocaliu ( carotenoid ) | -0,9 | 0,9 | 0,2 | 0,7 | -0.01 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | -0,9 | -0,8 | -1 | 0,9 | 0,2 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | -1 | 0,2 | -1 | -0,8 | |||||||
Pseudomonas | amigdalele | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | anguiliseptica | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | asplenii | fără interes medical, fitopatogen | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | balearica | 0,99 | 0,9 | -0,48 | 0,9 | -0,98 | -1 | 1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | ||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | caricapapayae | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | -0,48 | 0,9 | -0,98 | -1 | 1 | 1 | 1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | |||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | chlororaphis | fără interes medical | 0,99 | -1 | 0,7 | 0,2 | -0,9 | clororafină (pigment verde de fenazină = redus și galben = oxidat) | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | |||||
Pseudomonas | cichorii | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | citronellolis | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | coronafaciens | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | corrugata | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | ficuserectae | fără interes medical, fitopatogen | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | flavescens | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | fragi | fără interes medical, pe carnea putredă | 0,99 | 0,9 | -0,9 | -1 | 1 | 1 | 1 | 1 | 1 | ||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | fuscovaginae | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | luni | nu este relevant din punct de vedere medical, psihotrofic izolat de carne | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | marginalis | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | meliae | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | mendocina | col pigm maro-galben = pigment carotenoid intracelular | 0,99 | 0,9 | -1 | -0,9 | -0,9 | galben-portocaliu ( carotenoid ) | -0,9 | 0,9 | 0,88 | 1 | -1 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | -1 | 0,9 | 0,9 | -1 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -1 | 1 | -0.01 | 0,9 | ||||||
Pseudomonas | mucidolens | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | oleovorani | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | stutzeri | omniprezent | 0,99 | 0,9 | -1 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,88 | -0,21 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,96 | -1 | 0,2 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -1 | 0,7 | 0,21 | 0,96 | |||||
Pseudomonas | pseudoalcaligenele | 0,99 | 0,9 | -1 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | 0,7 | 0,2 | 0,2 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -1 | 0,9 | 0,9 | 0,2 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,2 | 0,9 | -1 | -0,9 | ||||||||||
Pseudomonas | resinovorani | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | savastanoi | fără interes medical, fitopatogen al măslinului | 0,99 | 0,9 | 1 | -1 | 1 | -1 | 0,44 | ||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | stanieri | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | rhodesiae | în apele minerale | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | jessenii | în apele minerale | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | mandelii | în apele minerale | 0,99 | 0,9 | -0,48 | -0,9 | -0,98 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | |||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | gessardii | în apele minerale | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | migulai | în apele minerale | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | libanensis | în apele de izvor libaneze | 0,99 | 0,9 | 0,3 | -1 | 1 | 1 | -1 | -1 | -1 | 1 | |||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | cedrella | în apele de izvor libaneze | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | orientalis | în apele de izvor libaneze | 0,99 | 0,9 | -0,9 | 1 | 1 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | |||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | seringi | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | avellanae | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | -0,48 | 0,9 | -0,98 | -1 | -1 | 1 | 1 | -1 | 1 | 1 | 1 | 0,5 | |||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | taetroleni | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | tolaasii | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | viridiflava | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | aureofaciens | fără interes medical | 0,99 | -1 | 0,7 | 0,9 | -0,9 | portocaliu = fenazin -1-carboxilat | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,48 | 0,9 | -0,98 | 0,2 | 0,2 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,2 | 0 | 0,2 | 1 | -0,5 | -1 | -1 | 1 | -1 | 1 | 0,01 | 1 | 0,5 | 0,2 | ||||
Pseudomonas | sacharophila | fără interes medical | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | veronii | în apele minerale | 0,99 | 0,9 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | roșie | 0,99 | 0,9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | glicină | 0,99 | 0,9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | phaseolicola | 0,99 | 0,9 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pseudomonas | fluorescenți | II | 0,99 | -1 | 0,98 | 0,1 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,46 | 0,6 | -0,9 | 0,3 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 1 | 0,9 | 0,9 | 0,1 | 1 | -1 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,9 | ||
Pseudomonas | fluorescenți | III | 0,99 | -1 | 0,98 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,46 | -0,22 | -0,9 | 0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 1 | -0,9 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,1 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,9 | ||
Pseudomonas | fluorescenți | IV | 0,99 | -1 | 0,98 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,46 | 0,9 | -0,89 | 0,9 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | 1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | 1 | 1 | 1 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,9 | ||
Pseudomonas | fluorescenți | V | 0,99 | -1 | 0,5 | 0,1 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,46 | 0,9 | -0,9 | 0,1 | 0,1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,98 | 1 | 0,1 | 0,9 | 0,1 | 0,1 | 0,2 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | 0,9 | -0,98 | 0,98 | -0,75 | 0,98 | ||
Pseudomonas | monteilli | 0,99 | -1 | -0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | -0,9 | 0,9 | -1 | -0,9 | 0,9 | 0,9 | -0,9 | -1 | 0,9 | 0,9 | 0,9 | 1 | 0,9 |
Aproape toate speciile au oxidază (vezi tabelul).
Degradarea glucozei se realizează pe ruta Entner-Doudoroff , această proprietate este demonstrată pe mediul Hugh-Leifson . Au frecvent o arginină dihidrolază care permite degradarea argininei în anaerobioză.
Unele specii pot extrage oxigenul eliberat prin reducerea nitraților la azot și astfel să crească anaerob; aceasta este denumită apoi „ respirație cu nitrați ”.
Unele specii sau tulpini de pseudomonas produc acetonă (otrăvitoare).
Producția de pigmențiMulți reprezentanți ai acestui gen produc pigmenți. Acestea includ cele utilizate pentru identificare:
Lista speciilor care ar trebui excluse din genul Pseudomonas :