O legătură izopeptidică este o legătură peptidică care se găsește în lanțul principal al proteinei . Această legătură se formează între funcțiile „ acid carboxilic ” și „ gruparea amino ” ale unui lanț lateral (FIG. 1).
Legăturile izopeptidice se pot forma între amina lanțului lateral al lizinei și grupările carboxil ale lanțului lateral al glutamatului sau aspartatului .
Formarea legăturii poate fi catalizată enzimatic, ca și în cazul legăturii formate între lizină și glutamină , care este catalizată de transglutaminaze , sau se pot forma spontan observate în formarea capsida de bacteriofag HK97 și Gram pozitivi bacteriile din pili .
Formarea spontană a unei legături izopeptidice necesită prezența unui alt reziduu, acid glutamic , care catalizează formarea de legături induse de proximitate.
Un exemplu de peptidă mică care conține o legătură izopeptidică este glutationul , care are o legătură între lanțul lateral al unui reziduu de glutamat și grupul amină al unui reziduu de cisteină .
Un exemplu de proteină implicată în legarea izopeptidică este ubiquitina , care se leagă de alte proteine prin legarea între glicina C-terminală a ubiquitinei și un lanț lateral lizină al proteinei substratului.
Legăturile izopeptidice sunt una dintre modificările comune post-traducere .
Recent, cercetătorii au exploatat formarea spontană a unei legături izopeptidice pentru a crea o nouă etichetă numită peptidă isopeptag (în) .
Isopeptagul poate reacționa spontan și ireversibil cu partenerul său de legare printr-o legătură isopeptidică covalentă.
Aplicațiile acestui nou instrument molecular pot fi: direcționarea proteinelor in vivo, microscopia cu fluorescență și dezvoltarea de noi arhitecturi de proteine pentru biologia sintetică .