Uracil-ADN glicozilaza

Uracil-ADN glicozilaza Descrierea acestei imagini, comentată și mai jos Structura unui UDG uman ( PDB  1AKZ ) Date esentiale
Nr. CE CE 3.2.2.27
Activitatea enzimatică
IUBMB Intrare IUBMB
IntEnz Vizualizare IntEnz
BRENDA Intrarea BRENDA
KEGG Intrare KEGG
MetaCyc Calea metabolică
PRIAM Profil
PDB Structuri

Glicozilaza ADN-uracil ( UDG sau UNG ) este un glycosylase care cliveaza uracil prezent în ADN - ul si initiaza repararea ADN - ului prin excizie . Procedând astfel, previne mutageneza prin eliminarea uracilului prezent în ADN; uracilul poate rezulta din dezaminarea spontană a citozinei , o reacție obișnuită în condiții oxidative. Acest lucru este important deoarece potențialul mutagen al unui reziduu de uracil se propagă în timpul replicării ADN-ului  : uracilul se împerechează într-adevăr cu adenina, în timp ce citozina se împerechează cu guanina , astfel încât conversia unui reziduu de citozină în uracil poate duce la înlocuirea, într-una din cele două duble - molecule de ADN eșuat după replicare, ale unei perechi de guanină - citozină printr-o pereche de adenină - uracil. Această enzimă este foarte specifică și foarte rapidă, astfel încât poate scinda peste 10.000 de reziduuri de uracil pe ADN într-o celulă umană în fiecare zi . Celulele umane exprimă cinci până la șase tipuri diferite de glicozilaze ADN , toate care au un mecanism comun de clivare ca mijloc de reparare a ADN-ului și sunt fiecare specifice pentru un tip de leziune de bază.

Mecanism

Uracilele nu sunt baze prezente în mod natural în ADN, dar rezultă în principal din modificarea chimică a citozinelor prin dezaminare. Uracil-ADN glicozilaza hidrolizează legătura N- glicozidică dintre carbonul 1 'al deoxiribozei și poziția N3 a acestor uracile prezente anormal în ADN. Produsele reacției sunt uracil liber și o catenă ADN care conține un situs abasic sau un situs AP. Prin recunoașterea specifică a uracililor, această enzimă permite eliminarea acestei leziuni frecvente a ADN-ului.

Situl abasic este apoi preluat de mecanismul generic de reparare prin excizie de bază care implică, printre altele, resinteza bazei modificată de o ADN polimerază .

Note și referințe

  1. (în) Sudip S. Parikh, Clifford D. Mol, Geir Slupphaug, Sangeeta Bharati, Hans E. Krokan și John A. Tainer , "  Inițierea reparării exciziei de bază Revelată de structurile cristaline și cinetica de legare a uracil-ADN glicozilazei umane cu ADN  ” , Jurnalul EMBO , vol.  17, n o  17, Septembrie 1998, p.  5214-5226 ( PMID  9724657 , PMCID  1170849 , DOI  10.1093 / emboj / 17.17.5214 , citiți online )
  2. (în) Mary C. Longo, Berninger Mark S. și James L. Hartley , "  Utilizarea uracil ADN glicozilazei pentru a controla contaminarea reportată în reacțiile în lanț ale polimerazelor  " , Gene , Vol.  93, n o  1, Septembrie 1990, p.  125-128 ( PMID  2227421 , DOI  10.1016 / 0378-1119 (90) 90145-H , citiți online )
  3. (în) Laurence H Pearl , „  Structura și funcția în superfamilia uracil-ADN glicozilază  ” , Mutation Research / DNA Repair , Vol.  460, n oase  3-4, 30 august 2000, p.  165-181 ( PMID  10946227 , DOI  10.1016 / S0921-8777 (00) 00025-2 , citiți online )
  4. (în) Geir Slupphaug Clifford D. Mol, Bodil Kavli, Andrew S. Arvai, Hans E. Krokan și John A. Tainer , „  A-nucleotide flipping mecanism din structura umană uracil-ADN glicozilaza legată de ADN  ” , Natura , vol.  384, nr .  6604, 7 noiembrie 1996, p.  87-92 ( PMID  8900285 , DOI  10.1038 / 384087a0 , citiți online )
  5. (ro) Tomas Lindahl , "  Suprimarea mutagenezei spontane în celulele umane prin excizia-repararea bazei ADN  " , Mutation Research / Reviews in Mutation Research , vol.  462, n oase  2-3, aprilie 2000, p.  129-135 ( PMID  10767624 , DOI  10.1016 / S1383-5742 (00) 00024-7 , citiți online )