Domni | Bacterii |
---|---|
Ramură | Proteobacterii |
Clasă | Proteobacterii gamma |
Ordin | Enterobacterii |
Familie | Enterobacteriaceae |
Drăguț | Dickeya |
Dickeya dadantii sau Erwinia chrysanthemi (fost nume), este una dintre speciile de bacterii patogenealeplantelor care cauzează boala putregaiului moale ( putregaiul moale în engleză).
Dickeya dadantii , spectru larg gazdă fitopatogenă, este o bacterie până la gram-negativă , în formă de bacil, anaerobă facultativă și mobilă. Această bacterie provoacă boli de putregai moale . Se găsește frecvent în soluri sau la suprafața plantelor. Potrivit EPPO , Dickeya dadantii apare în multe regiuni ale lumii: Europa, Africa, Australia, America. În mai multe țări, este clasificat ca agent patogen al plantelor de carantină.
Inițial, Dickeya dadantii a fost clasificată în genul Erwinia . Erwin F. Smith, fitobacteriolog, a fondat acest gen în 1920, unde urmau să fie adunate toate bacteriile fitopatogene Gram-negative, sub formă de bacili. Dye propune separarea genului Erwinia în 4 grupe: bacterii care provoacă necroză, pectinolitice, Erwiniae cu pigment galben și Erwiniae atipice. Mai recent, studiul secvențelor de ADNr 16S de la diferiți membri ai genului a făcut posibilă împărțirea Erwiniae în 4 genuri:
Recent, un studiu al diferitelor secvențe de nucleotide a condus Samson și colab. a redenumi Erwinia chrysanthemi : Dickeya dadantii . Acest studiu sugerează cu tărie că Dickeya dadantii este legată de genul Yersinia .
Moale Boala putregai afecteaza multe culturi de temperat și în regiunile tropicale. În plus, spectrul gazdă al lui Dickeya dadantii este larg, ceea ce duce la multe daune. Plantele afectate sunt tuberculul cartofului , sfecla roșie , andive , roșii , ananas etc.
Perioada de incubație este destul de lungă. Poate dura câteva luni și este asimptomatic. Patogenitatea Dickeya dadantii a fost studiată de peste optzeci de ani. Progrese reale în înțelegerea bolii au fost făcute în ultimii douăzeci de ani, în special datorită abordărilor genetice și moleculare.
Diferiti parametri favorizeaza boala. În primul rând, apa este un element esențial pentru o dezvoltare optimă a bolii. Apoi pare necesară și o concentrație limitată de oxigen . În cele din urmă, temperatura este un factor important. S- a demonstrat că variația temperaturii afectează producția de enzime de degradare a peretelui celular. În plus, o temperatură de 20 ° C este o temperatură prag sub care patogenitatea nu mai este observată.
Patogenitatea bacteriilor se bazează pe macerarea țesuturilor. Această macerare este permisă de secreția exoenzimelor:
Aceste exoenzime degradează peretele celulelor vegetale care, pe de o parte, oferă nutrienți necesari creșterii bacteriene și, pe de altă parte, permite răspândirea bolii. Aceste enzime sunt secretate de diferite sisteme și în special de sistemul de secreție de tip II. Acest sistem de secreție face posibilă traversarea periplasmei și a celor două membrane.
Virulența „Dickeya dadantii” este foarte fin reglementată. De fapt, dezvoltarea bolii este corelată cu secvența determinată de etape care necesită adaptarea bacteriilor la noul său mediu, planta. O virulență bună se bazează pe un număr mare de regulatori care vor modula expresia genelor de virulență în timp.
Regulatori majori ai virulenței: PecS și KdgR Represorul KdgRKdgR este un regulator global al genelor implicate în catabolismul pectinei și al sistemelor asociate.
Represorul PecSPecS este un regulator al genelor pel , celV celulazei , genelor prtA, B, C și G , precum și al sistemului de ieșire și al operonului indABC implicat în producția unui pigment albastru: indigoidina.
Sisteme bicomponente și fosforelaysSistemele cu două componente sau fosforelais sunt jucătorii terminali în transmiterea semnalului. Aceste sisteme sunt cheia plasticității expresiei genelor în funcție de condițiile de mediu și multe dintre ele sunt esențiale pentru stabilirea infecției în bacteriile patogene. Acestea constau din cel puțin două proteine. Un senzor situat în membrana celulară se autofosforilează pe un reziduu de histidină ca răspuns la un stimul și transferă gruparea fosfat la regulatorul său citoplasmatic pe un reziduu de aspartat. Acesta din urmă va modula apoi expresia diferitelor gene țintă. Această modulare fină se realizează în funcție de raportul regulator fosforilat / regulator nefosforilat. Mai multe studii au arătat rolul crucial al anumitor fosforelay în virulența bacteriilor zoologice și fito-patogene. Cu toate acestea, deși cunoaștem din ce în ce mai bine funcționarea moleculară a acestor fosforelay, stimulii și modul lor de transmitere din mediul extern către senzorul membranei celulare sunt încă puțin înțelese.
În Dickeya dadantii , se știe că trei fosforele sunt direct implicate în virulență: PhoP / PhoQ, GacA / GacS (sau BarA / UvrY) sau RcsCD / RcsB.
Pentru a se apăra, planta folosește procese de apărare clasice. Se poate crea stres oxidativ cum ar fi H 2 O 2, principala formă activă de oxigen produsă în timpul exploziei oxidative a plantei. Unele plante sunt, de asemenea, capabile să producă peptide antimicrobiene, ceea ce arată existența genelor de rezistență.
Virulența lui Dickeya dadantii se bazează doar parțial pe secreția de enzime. În paralel, bacteria instalează sisteme de captare a fierului, sisteme de apărare împotriva stresului oxidativ și împotriva peptidelor antimicrobiene ale plantei, motilitate. Toți acești factori permit dezvoltarea bolii putregaiului moale.
La Dickeya dadantii , glucanii periplasmatici osmoregulați ( OPG ) sunt oligozaharide de dimensiuni intermediare a căror concentrație crește atunci când osmolaritatea mediului scade. Coloana vertebrală a acestora este alcătuită în întregime din molecule de glucoză. Dickeya dadantii are ramificat OPG liniar β-1,2 sau β-1,6 pentru ramuri cu o singură glucoză. Sinteza coloanei vertebrale OPG necesită produsul operonului opgGH . Proteina OpgH codifică o glucozil-transferază care asigură alungirea lanțurilor β-1,2 în timp ce proteina OpgG permite formarea legăturilor β-1,6.
Cei opgG sau opgH mutanti conduc la o absență totală a sintezei de glucani periplasmic, provocând o pierdere totală de virulenta.
Genomului de dadantii Dickeya a fost complet ordonate si este disponibil pe site - ul ASAP: http://asap.ahabs.wisc.edu/asap/query_features.php?LocationID=WIS&GenomeID=ECH3937 . Acesta va fi publicat în scurt timp, consultați http://asap.ahabs.wisc.edu/research-projects/plant-pathogen-genome-projects/dickeya-dadantii-erwinia-chrysanthemi-3937-genome-project.html .