Cartografierea genetică

Cartografierea genetică este construirea unui card este localizat în jurul unei gene sau a unei baze largi pe genomul întreg. Mai general, este determinarea poziției unui locus ( genă sau marker genetic ) pe un cromozom în funcție de rata de recombinare genetică . Unitatea sa de distanță este centimorganul (cM).

Obiectivul cartării genetice

Actul de cartografiere implică determinarea pozițiilor relative ale loci (gene sau secvențe de ADN) pe un cromozom . Hărțile de legătură sunt obținute din frecvența recombinării dintre loci . Hărțile fizice sunt în general obținute prin utilizarea hibridizării in situ a fragmentelor de ADN clonate cu cromozomi metafazici sau prin utilizarea hibrizilor somatici sau a hibrizilor de iradiere.

Istoria cartografierii genetice

Prima hartă genetică a fost realizată în 1913 de Thomas Hunt Morgan și Alfred Sturtevant pe cromozomul X al Drosophila . Prima plantă cartografiată a fost porumbul în 1935 folosind tehnica markerului fenotipic. Tehnica etichetării moleculare este mult mai recentă.

Tipuri de cărți

O hartă fiind o diagramă reprezentând poziția relativă a loci pe un cromozom și distanțele dintre acestea, distingem următoarele tipuri de hărți:

De Hărțile citologice de gene asociate cu mutații pot fi realizate atunci cand anumite mutatii cromozomiale au un suport care poate fi detectat prin colorare tehnici de benzi de cromozomi.

Tipuri de hărți

Cartografierea comparativă este compararea localizarea genelor si markere pe harta cromozomială între specii . În comparații între specii strâns legate, găsim un grad ridicat de conservare:

În acest caz, localizarea mai multor gene poate fi prezisă utilizând un model de date. Comparațiile dintre speciile îndepărtate filogenetic arată o creștere a pierderii de sinteză.

Cartografiere S1 este o metodă pentru caracterizarea posttranscriptionelles modificari in ARN ( despicare de introni , etc.) , prin hibridizarea ARN cu un ADN monocatenar și tratamentul cu nucleaza S1.

Note și referințe

  1. Aranjamentul liniar al șase factori legați de sex în Drosophila , după cum arată modul lor de asociere [PDF] Journal of Experimental Zoology , 14: 43-59, 1913