Xanthomonas oryzae pv oryzae

Xanthomonas oryzae
pathovar oryzae Descrierea acestei imagini, comentată și mai jos Simptomele bolii bacteriene cauzate de Xanthomonas oryzae pv oryzae pe orez. Clasificare
Domni Bacterii
Ramură Proteobacterii
Clasă Gammaproteobacterii
Ordin Xanthomonadales
Familie Xanthomonadaceae
Drăguț Xanthomonas
Specii Xanthomonas oryzae

Pathovar

Xanthomonas oryzae pathovar oryzae
(ex ? Ishiyama 1922 ) Swings și colab. , 1990

Xanthomonas oryzae pv oryzae este una dintre cele două pathovars atașate la Xanthomonas oryzae , specii de proteobacterii , aparținând familiei de Xanthomonadaceae .

Această bacterie, a cărei gazdă principală este orezul ( Oryza sativa ), este responsabilă pentru una dintre cele mai grave boli ale orezului , denumită boală a orezului bacterian (sau risul bacterian al orezului ), sau „  kresek  ” în Asia de Sud-Est. Este prezent în majoritatea regiunilor din lume, cu excepția bazinului mediteranean .

În condiții favorabile bolii, pierderile de randament pot ajunge la 70%.

Genomului acestei bacterii (MAFF tulpina 311018) a fost secvențiat în 2005 de către un japonez echipa . Acest genom, format dintr-un singur cromozom circular, are o dimensiune de 4.940.217  bp . Structura sa este caracterizată de un număr mare de gene efectoare (avr). Această bacterie este considerată un organism model pentru analiza interacțiunii plante-agent patogen, deoarece peste 30 de rase diferite sunt cunoscute prin virulența lor și că 25 de gene de rezistență au fost identificate în orez (al cărui genom a fost identificat și. Secvență).

Sinonime

Gama de gazdă

Pe lângă orezul cultivat, Xanthomonas campestris pathovar oryzae admite ca plante gazdă diverse specii de Poaceae (Ierburi) și Cyperaceae (Carex).

Dintre Poaceae , găsim în special: Cenchrus ciliaris (Rhodesian cenchrus), Cynodon dactylon ( houndstooth quackgrass), Echinochloa crus-galli (iarba cocoșului), Leersia hexandra , Leersia japonica , Leersia oryzoides (fals orez leersia), Leersia sayauka , Leptochloa chinensis , Leptochloa panicea , Oryza sp. (specii din genul Oryza , în special Oryza rufipogon și Oryza australiensis în Australia), Panicum maximum (iarba Guinea), Paspalum scrobiculatum (iarba sabiei), Urochloa mutica (Para iarba), Zizania aquatica (orez sălbatic), Zizania palustris (sălbatică) orez) și Zoysia japonica (zoysia japoneză);

iar printre Cyperaceae  : Cyperus difformis ( nucă cu flori mici), Cyperus rotundus (nucă).

Leersia sayanuka este cea mai importantă gazdă din Japonia, deoarece această specie asigură supraviețuirea bacteriilor în timpul iernii și se găsește frecvent în zonele în care boala este endemică.

Note și referințe

  1. Roskov Y., Ower G., Orrell T., Nicolson D., Bailly N., Kirk PM, Bourgoin T., DeWalt RE, Decock W., van Nieukerken EJ, Penev L. (eds.) (2020). Species 2000 & ITIS Catalog of Life , 2020-12-01. Resursă digitală la www.catalogueoflife.org . Specie 2000: Naturalis, Leiden, Olanda. ISSN 2405-8858, accesat la 26 octombrie 2014
  2. „  Fișă informativă privind dăunătorii din carantină - Xanthomonas oryzae  ” , EPPO (accesat la 25 octombrie 2014 ) .
  3. (în) Hirokazu Ochiai, Yasuhiro Inoue, Masaru Takeya, Aeni Sasaki și Hisatoshi Kaku, „  Genome Sequence of Xanthomonas oryzae pv. oryzae sugerează contribuția unui număr mare de gene efectoare și secvențe de inserție la diversitatea sa rasială  ” , Japanese Agricultural Research Quarterly (JARQ) , vol.  39, n o  4, 2005), p.  275–287 ( citește online ).
  4. (în) "  frunze bacteriene ale orezului - Xanthomonas oryzae pv. oryzae (ex. Ishiyama 1922) Swings și colab. 1990  ” , pe Invasive.org (accesat la 25 octombrie 2014 ) .
  5. (în) "  Xanthomonas oryzae pv. oryzae  ” pe Ancheta Cooperativă a Dăunătorilor Agricoli (CAPS) (accesat la 26 octombrie 2014 ) .
  6. (în) „  Evaluarea riscului: Xanthomonas oryzae pv. oryzae, frunze bacteriene sau boala kresek  ” , NCSU / APHIS Plant Pest Forecast (NAPPFAST) (accesat la 26 octombrie 2014 ) .
  7. (în) Shu Huang Or, Rice Boals , CAB International / IRRI ,1985, 380  p. ( ISBN  978-0-85198-545-9 , citit online ) , p.  79.

linkuri externe