Marker de secvență exprimat

O etichetă de secvență exprimată , sau o etichetă de secvență exprimată ( EST ) este o porțiune scurtă secvențiată de un ADN complementar (ADNc), utilizată ca marker pentru a diferenția genele împreună într-un ADN de secvență și a identifica genele omoloage în alte sume.

Deoarece este de obicei destul de ușor să extrageți fire de ARNm din celule, biologii iau aceste secvențe și le convertesc în ADNc , care este mult mai stabil. Un ARNm fiind în mod necesar expresia unei gene a genomului, acest ADNc nu este o copie exactă a secvenței de ADN care a generat ARN deoarece, în urma îmbinării , ARN-ul nu păstrează regiunile necodificatoare ale ADN-ului ( introni ).

Dacă genomul este corect identificat, genele care îl compun nu sunt încă toate. Și unele gene identificate au o funcție încă necunoscută. Folosind EST-uri, încercăm să identificăm o genă pe calea inversă, adică luăm secvența ARN pentru a găsi secvența ADN care a creat-o. Acest lucru va face posibilă localizarea genei în genom, fără a avea informații despre genă în sine.

Pentru a căuta secvența ADN originală, se folosește doar o parte din informațiile conținute în ADNc, aproximativ o sută de nucleotide . Această subsecvență este luată la începutul sau la sfârșitul secvenței. Începutul este relativ bine conservat de la o specie la alta; de asemenea, pentru a identifica în mod unic gena ofensatoare, există tendința de a folosi sfârșitul secvenței ca bază pentru cercetare.

Note și referințe

  1. Ghislaine Cleret de Langavant, Bioetică: metodă și complexitate [ citește online ] , pp. 241-242, PUQ, 2001, 309 p. ( ISBN  2-7605-1106-5 ) .

Vezi și tu

linkuri externe