Distanțier transcris intern
Intern Distanțierul transcris (sau intern distanțierul transcris (ITS) în limba engleză) este o porțiune a ADN - ului ribozomal localizat între gena subunității mici și mari a ribozomului acidului ribonucleic . Este utilizat în filogenie de eucariote și codurile de bare ADN fungi sau cianobacterii .
Distanțierii transcriși interni au rate de mutație semnificativ mai mari ca urmare a inserțiilor, ștergerilor și mutațiilor punctuale , ceea ce face inoperantă o comparație a secvențelor ITS între specii larg separate, cum ar fi oamenii și broaștele, de exemplu. Cu toate acestea, este utilizat cu succes pentru analize filogenetice între speciile învecinate.
Exemplu de utilizare a distanțierului transcris intern: cladograma speciilor Caenorhabditis
|
Caenorhabdita
|
|
Elegans
|
|
C. neașteptat
|
|
|
C. sp. 35
|
| Elegans
|
|
|
|
|
|
|
C. wallacei
|
|
|
C. tropicalis
|
|
|
|
|
|
C. brenneri
|
|
|
C. doughertyi
|
|
|
|
|
|
|
C. elegans
|
|
|
| Japonica
|
|
|
|
|
|
C. nouraguensis
|
|
|
C. yunquensis
|
|
|
|
|
C. macrosperma
|
|
|
|
|
|
|
|
|
|
C. japonica
|
|
|
|
|
C. kamaaina
|
|
|
|
|
| Drosophilae
|
|
|
|
|
|
|
C. monodelphis
|
|
|
C. plicata
|
|
|
|
|
|
|
Cladograma speciilor de Caenorhabditis , pe baza comparării secvențelor „distanțierului transcris intern” conform lui Félix și colab. , 2014.
|
Istoric
Michel Delseny , director de cercetare emerit la CNRS și membru al Académie des sciences, a fost primul care a raportat secvența distanțieră a genelor care codifică ARN-urile ribozomale ale unui dicotiledonat în 1988 și care a arătat baza eterogenității genelor ribozomale din plante.
Note și referințe
-
(în) Masayuki Sumida, Yoji Kato și Atsushi Kurabayashi , " Secvențierea și analiza distanțierilor transcrise interne (ITSS) și a regiunilor de codificare în fragmentul EcoRI al ADN-ului ribozomal al broaștei de iaz japoneză Rana nigromaculata " , Genes & Genetic Systems , vol. 79, n o 2
Aprilie 2004, p. 105-118 ( PMID 15215676 , DOI 10.1266 / ggs.79.105 , citiți online )
-
(în) Felix, Marie-Anne; Braendle, creștin; Cutter, Asher D. (11 aprilie 2014). "Un sistem simplificat pentru diagnosticarea speciilor în Caenorhabditis (Nematoda: Rhabditidae) cu denumiri pentru 15 specii biologice distincte". PLUS UNU. 9: e94723. DOI : 10.1371 / journal.pone.0094723
-
M. Delseny și colab., „ Secvențe de eterogenitate în genele de ARN ribozomal nuclear de ridiche ”, Plant Sci. Scrisori , (1983), 30, p. 107-111
-
D. Delcasso-Tremousaygue și colab., „ Caracterizarea structurală și transcripțională a distanțierului extern al unei gene nucleare de ARN ribozomal de la o plantă superioară ”, Eur. J. Biochem. , (1988), 172, p. 767-776
linkuri externe