Ciclator termic

Termociclor ( de asemenea , numit cycler termic sau mașină PCR ) este un dispozitiv care automatizează sau „clasic“ , „punct final“ PCR reacția .

Descrierea dispozitivului

Aparatul este prevăzut cu un bloc termic („bloc termic”) cu găuri în care se pot introduce tuburile care conțin amestecul de reacție al PCR.

Unele modele permit efectuarea gradienților termici de la o parte la alta a blocului termic. Această funcție este utilizată atunci când dorim să găsim cea mai bună temperatură de hibridizare pentru o pereche dată de primer.

Dispozitivele moderne sunt echipate cu un acoperiș încălzit care apasă pe capacele tuburilor, evitând evaporarea amestecului de reacție și, prin urmare, trebuie să pună un strat de ulei mineral în tub, deasupra mediului de reacție .

O tastatură constă din câteva butoane și un afișaj LCD utilizat pentru a introduce programe în memoria aparatului.

Primul preț pentru un ciclotermic este de aproximativ 500 USD .

Program PCR

Exemplu de program:

Notă: etapa de alungire este definită în funcție de lungimea așteptată a fragmentului de amplificat. Se consideră că polimeraza Taq sintetizează aproximativ 1000 de baze / minut. Pentru o lungime așteptată de 500 bp , este suficientă 30 de secunde de alungire.

Program de secvențiere

De obicei, include doar aproximativ douăzeci de cicluri.

Program de denaturare

Acest program se numește, în general, „DENAT”. Acesta constă dintr-o singură etapă la 95 ° C timp de 10 sau 15 minute. La sfârșitul ciclului, trebuie să fiți prezent pentru a îndepărta rapid benzile de probă pentru a le scufunda rapid în gheață. Aveți grijă, unitatea de termociclare este fierbinte, nu trebuie să vă ardeți.

Crocodil

În anii 1980, dealerul de crocodili (Il deal) (cunoscut încă cu afecțiune sub numele de crocodil ) a fost unul dintre primele dispozitive vândute la prețuri accesibile și, prin urmare, a avut o distribuție largă. A folosit tuburi de 0,5 ml. Nu avea acoperiș încălzit. A fost necesar să se aplice un strat de ulei mineral pentru a preveni evaporarea mediului de reacție. Nu a folosit efectul Peltier pentru răcire, ci un ventilator.

Miniciclist

MiniCycler este produsa de MJ Research . Are 16 sonde și folosește efectul Peltier pentru a răci tuburile.

PTC

Seria PTC este produsă de MJ-Research . Aceștia sunt termociclatori cu efect Peltier cu acoperiș încălzit. Sunt echipate cu un bloc pentru 96 de tuburi de 0,2 ml. Gradienții de temperatură ating 3 ° C pe secundă.

Surse

  1. (în) "  OpenPCR: Ciclatorul termic Open Source PCR | Chai  ” , pe www.chaibio.com (accesat la 13 mai 2018 )