Teritoriul Uniunii Comorelor este împărțit în 3 insule autonome și acestea în 54 de municipalități (Legea nr. 11-006 / AU din2 mai 2011, promulgat pe 21 iulie 2011). Din motive administrative, municipalitățile sunt grupate în 16 prefecturi , distribuite după cum urmează:
Insula autonomă Grande Comore (Ngazidja)