Un locus de trăsătură cantitativă ( LCQ sau QTL pentru loci de trăsătură cantitativă ) este o regiune mai mare sau mai mică a ADN-ului, care este strâns asociată cu o trăsătură cantitativă , adică o regiune cromozomială în care sunt situate una sau mai multe gene . La originea caracterului în cauză .
Moștenirea trăsăturilor cantitative se referă la o fenotipică caracteristică care variază în funcție de grade, și care poate fi atribuită interacțiunii dintre două sau mai multe gene și mediul lor (numită moștenire poligenică).
QTL-urile pot fi identificate „ molecular ” (prin PCR , de exemplu) pentru a ajuta la cartografierea regiunilor genomului care conțin gene implicate în specificarea unei trăsături cantitative.
Acest lucru contribuie la identificarea, adnotarea și secvențierea acestor gene sau gene numite „gene de interes”.
O trăsătură care prezintă variații continue în cadrul unei populații (trăsătură cantitativă) se presupune că este controlată de mai multe gene cu efect slab: model infinitesimal. Cu toate acestea, s-a demonstrat că câteva gene majore (QTL) ar putea participa semnificativ la această variabilitate (model oligogen).
Analiza QTL urmărește să caracterizeze arhitectura genetică a unui tip de trăsătură: adică să determine numărul de regiuni ale genomului implicat, precum și pozițiile și efectele acestora. Această abordare se bazează pe analiza combinată a informațiilor moleculare și un caracter cantitativ în descendenții segregați. Face posibilă testarea statistică a legăturii dintre variația genetică (cum ar fi cea a markerilor moleculari) și variația fenotipică. Dacă acest test este semnificativ, este evidențiat un QTL.
Pornind de la o analiză simplă a markerului (analiza unică a varianței), analiza QTL a evoluat în metode din ce în ce mai complexe:
În plus față de aceste metode clasice, au fost dezvoltate și abordări bayesiene, dar rămân puțin utilizate în prezent pentru plante.
Ca și în cazul tuturor analizelor statistice, dimensiunea eșantionului este un factor critic. Pentru dimensiunile de probă mici, riscul de a nu detecta un QTL cu efect scăzut este semnificativ. Prin urmare, acest lucru supraestimează efectul celor detectate. Acest lucru este denumit în mod obișnuit efectul „Beavis”.