Persoanele lesbiene, homosexuale, bisexuale și transgender (LGBT) din Nigeria se confruntă cu dificultăți fără cetățeni non-LGBT. Relațiile sexuale dintre bărbați și femei sunt ilegale în Nigeria și marea majoritate a țării respinge homosexualitatea.
Potrivit Pew Global Attitudes Project din 2007 , 97% dintre nigerieni spun că homosexualitatea ar trebui „respinsă” de companie, făcându-l una dintre lansările de homosexualitate cele mai puternice dintre cele patruzeci și patru de țări analizate.
Homosexualitatea din Nigeria este ilegală în temeiul articolelor 214 și 217 din capitolul 21 din Codul penal nigerian și poate fi pedepsită cu până la paisprezece ani de închisoare în toată Nigeria. În cele douăsprezece state care au adoptat Sharia, sodomia ( Liwat ) este pedepsită cu o sută de gene (pentru bărbații musulmani necăsătoriți) și un an de închisoare și moarte prin lapidare pentru bărbații musulmani căsătoriți sau divorțați.
20 ianuarie 2009, Parlamentul din Nigeria adoptă o lege care pedepsește participarea la căsătoria între persoane de același sex cu închisoare și interzice orice asociere sau manifestare homosexuală. Această lege a fost ratificată de președintele Jonathan în ianuarie 2014. Pedepseste căsătoria și coabitarea între persoane de același sex cu 14 ani de închisoare. Acesta prevede o pedeapsă de 10 ani închisoare pentru orice persoană care participă la o organizație sau demonstrație homosexuală, precum și pentru orice manifestare publică de afecțiune între persoane de același sex.
Codul penal Sharia interzice „bărbaților să se îmbrace ca femei sau să vorbească despre ei înșiși ca femei”, un mod de a interzice femeile trans și bărbații trans.
Puțini oameni spun că sunt homosexuali.
În 2004, Bisi Alimi a devenit o persoană publică când a apărut la Televiziunea Națională Nigeriană ca oaspete la Funmi Iyanda la emisiunea New Dawn with Funmi , unde a ieșit și a împărtășit spectatorilor diagnosticul său de purtător de HIV. De asemenea, el a cerut în timpul interviului acceptarea socială a publicului nigerian. Acest act a dus la respingerea familiei sale și a majorității prietenilor săi, chiar și a celor din comunitatea LGBT nigeriană. În plus, ieșirea sa a pus capăt live-ului emisiunii New Dawn with Funmi , care a fost înregistrată și editată înainte de difuzare.
Ostilitatea față de relațiile de același sex este răspândită și violența împotriva persoanelor LGBT este frecventă.
12 septembrie 2008, ziarele au publicat numele, adresele și fotografiile a doisprezece membri ai bisericii Rainbow House Metropolitan Community Church , o biserică prietenoasă LGBT din Lagos . Câțiva dintre cei vizați au fost amenințați, bătuți și lapidați. O femeie a fost atacată de unsprezece bărbați. La sfârșitul anului 2008, autoritățile încă nu investigaseră aceste atacuri. Membrii bisericii au fost alungați sau au pierdut slujba. Alții au trebuit să se ascundă. Biserica a trebuit să închidă din cauza hărțuirii și amenințărilor poliției.
Discriminarea transportatorilor HIV este larg raspandita, SIDA fiind condamnat ca un comportament imoral, chiar și în cazul în care campaniile de prevenire au fost efectuate pentru a reduce stigmatizarea asociate cu SIDA.