Holliday Junction

O joncțiune Holliday este o joncțiune mobilă între patru fire de ADN . Structura își ia numele de la Robin Holliday , care a propus-o în 1964 pentru a explica un anumit tip de schimb de informații genetice pe care l-a observat în Ustilago maydis , recombinarea omologă . Acestea sunt de fapt un intermediar în timpul procesului de recombinare genetică, foarte important pentru menținerea integrității genomului.

Joncțiunea Holliday este în general simetrică, ceea ce permite deplasarea specifică într-un model care păstrează asocierea bazelor. Aceasta înseamnă că cele 4 brațe individuale pot aluneca unele peste altele în timp ce rețin structura.

Structura

Joncțiunile Holliday pot exista în diferite conformații cu diferite modele de suprapunere coaxială între cele 4 brațe ale dublei spirale ADN. Suprapunerea coaxială este tendința capetelor contondente ale acizilor nucleici de a se lega împreună prin interacțiuni între bazele expuse. Există trei posibile conformații: o formă fără fire suprapuse și două forme cu fire ADN suprapuse. În absența cationilor divalenți, cum ar fi Mg2 +, forma care nu se suprapune este prioritară datorită repulsiei electrostatice între sarcinile negative ale firelor de ADN. În prezența minimului 0,1 mM Mg2 +, repulsia electrostatică este diminuată și predomină formele cu suprapunere.

Joncțiunile Holliday în recombinare omoloagă sunt compuse din secvențe identice sau aproape identice, ceea ce înseamnă că joncțiunea centrală are o dispunere simetrică. Acest lucru permite migrarea firelor. Scindarea sau rezoluția joncțiunii Holliday se poate face prin două metode. În prima metodă, există decolteul dublu catenar al catenei destinatarului sau a catenei invadatoare. În produsul final, se observă o conversie a genei la nivelul catenei destinatarului provenind de la catena invadatoare fără ca acesta din urmă să fie modificat sau invers. În cea de-a doua metodă, există un clivaj dublu catenar la cele două cromatide. Există o încrucișare între cromatide, care permite un schimb de material genetic între regiunile omoloage. Indiferent de metoda efectuată, obținem regiuni heteroduplex în regiunea în care a avut loc formarea joncțiunii Holliday.

Funcţie

Joncțiunea Holliday este un intermediar în recombinarea omoloagă , un proces biologic care crește diversitatea genetică prin recombinarea genelor între doi cromozomi. Joncțiunea Holliday este, de asemenea, prezentă în recombinarea specifică site-ului care necesită integraze, în plus față de evenimentele de reparare a ADN-ului cu dublu fir. Mai mult, joncțiunile Holliday pot apărea în structurile cruciforme ale ADN-ului non-B pentru a reduce stresul pe spirale indus de secvențe simetrice de ADN supraînfășurat .

Rezoluţie

Într-o joncțiune Holliday, două duplexuri omoloage sunt legate printr-un schimb de nucleotide între două catene de ADN dublu catenar. Prin urmare, joncțiunea implică prezența a 4 fire de ADN. Formarea joncțiunii Holliday începe cu formarea unei bucle D de ADN în care un fir dintr-un duplex invadează al doilea duplex. Acest lucru creează regiuni heteroduplex ale ADN-ului, adică regiuni în care ADN-ul celor două fire este complementar. Scindarea buclei D urmată de ligare creează joncțiunea Holliday. Duplexurile astfel legate vor adopta apoi o formă plană în urma interacțiunilor cu proteinele recombinante . În acest stadiu, observăm două regiuni homoduplex și două regiuni heteroduplex creând astfel două axe de simetrie, o axă verticală și o axă orizontală. O proteină recombinazică este apoi capabilă să despice firele de-a lungul acestor axe de simetrie. În funcție de axa despicată, produsele vor varia. În cazul în care clivajul are loc de-a lungul axei orizontale, cele două fire fiice vor diferi de firele parentale doar în parte a secvenței lor, se va efectua un schimb genetic între regiunile omoloage între firele parentale. Un produs este obținut fără recombinare genetică , adică firele părintești sunt încă legate între ele. Cu toate acestea, dacă clivajul are loc de-a lungul axei verticale, va exista o încrucișare între cromatide . Un produs este obținut prin recombinare genetică în cazul în care firele părintești au fost schimbate.

Vezi și tu

Referințe

  1. (ro) Stahl FW, „  Joncțiunea Holliday la cea de-a treizecea aniversare  ” , Genetica , vol.  138, n o  21 st octombrie 1994, p.  241–246   ( PMID  7828807 , citiți online [ PDF  ])
  2. (în) Liu Y, S West, „  Happy Hollidays: 40th anniversary of the Holliday junction  ” , Nat Rev Mol Cell Biol , vol.  5, n o  11,2004, p.  937–44 ( PMID  15520813 , DOI  10.1038 / nrm1502 )
  3. (în) Hays FA J Watson, PS Ho, "  Atenție! ADN Crossing: Crystal Structures of Holliday Junctions  ” , J Biol Chem , vol.  278, nr .  50,2003, p.  49663–49666 ( DOI  10.1074 / jbc.R300033200 )
  4. (ro) Fu TJ, Tse-Dinh YC, Seeman NC, "  Holliday junction crossover topology  " , J. Mol. Biol. , vol.  236, n o  1,1994, p.  91-105 ( PMID  8107128 , DOI  10.1006 / jmbi.1994.1121 )
  5. (în) David MJ Lilley , „  Structuri ale joncțiunilor elicoidale în acizi nucleici  ” , Trimestrial Reviews of Biophysics , vol.  33, n o  2Mai 2000, p.  109–159 ( ISSN  0033-5835 și 1469-8994 , DOI  10.1017 / s0033583500003590 , citit online , accesat la 5 ianuarie 2019 )
  6. (ro) Bloomfield, Victor A. și Tinoco, Ignacio. , Acizi nucleici: structuri, proprietăți și funcții , Sausalito, California, University Science Books,2000, 794  p. ( ISBN  0-935702-49-0 și 9780935702491 , OCLC  39936769 , citit online )

linkuri externe

Toate aceste linkuri sunt în limba engleză