Istoria evreilor din Macedonia începe în antichitate. Populația evreiască este întărită în perioada otomană, care a prosperat în orașele macedonene. Majoritatea evreilor au fost uciși în timpul Holocaustului și astăzi doar aproximativ 200 de evrei rămân pe teritoriul Macedoniei de Nord contemporane.
Evreii au locuit în regiunea Macedoniei încă din perioada romană, dovadă fiind resturile arheologice ale unei sinagogi antice din Skupi . Ulterior, evreii s-au întors în regiune, fiind persecutați de romani în Israel. Prezența evreilor este atestată și de scrisoarea lui Agrippa către Caligula .
În secolul al II- lea, săpăturile arheologice relevă existența unei comunități evreiești în orașul Stobi .
După perioada romană, evreii care locuiesc în Macedonia sunt romiți . Sunt masacrați în timpul primei cruciade.
Spre sfârșitul XIV - lea secol, evreii au găsit refugiu în comunele macedonene ca Salonika devine un important centru comercial și textile. Sultanul Mehmet al II - lea de locul evreilor din Ohrid , care a fost o sinagogă până la XIX - lea secol. Ca evrei cunoscuți din Ohrid, există talmudistul Iuda Leon ben Moses Mosconi și Leo II Mung, un convertit care devine arhiepiscop al orașului.
În Skopje , sinagoga Beth Aharon a fost construită în 1366.
În perioada otomană, refugiații evrei din Inchiziție, care fugeau din Spania și Portugalia, s-au stabilit în orașele macedonene. Ei prosperă în comerț și în discipline precum medicina și dreptul. Evreii au avut relații bune cu populația macedoneană.
Cimitirul evreiesc din Bitola a fost înființat în 1497. În Skopje, The XVII - lea secol, existau 3000 de evrei și două sinagogi, Beit Aron și Beit Yaacov.
În vârf, comunitatea evreiască a Bitolei avea nouă sinagogi, trei din Skopje și două din Štip .
La sfârșitul stăpânirii otomane, evreii au participat la mișcarea de emancipare macedoneană, cum ar fi Rafael Moshe Kamhi .
Înainte de al doilea război mondial, în Bitola locuiau 8000 de evrei în Skopje 3000 de evrei, iar în Stip 500 de evrei.
Armata bulgară a ocupat teritoriul Macedoniei și i-a persecutat pe evrei, care au fost ulterior deportați în 1943 la Treblinka .
În martie 1943, 7.215 persoane au fost reținute în depozitele din Skopje înainte de deportarea lor în lagărele de moarte, printre care: