Scopul acestei pagini este de a prezenta un copac filogenetic al Excavatei ( Excavobionta , Excavés , Excavates), adică o cladogramă care evidențiază relațiile de rudenie existente între diferitele grupuri (sau taxoni) ale acestora, precum le oferă ultimele analize recunoscute . Aceasta este doar o posibilitate, iar principalele dezbateri care rămân în cadrul comunității științifice sunt prezentate pe scurt mai jos, înainte de bibliografie.
Cladograma prezentată aici este destinată să fie în concordanță cu cele mai recente analize publicate și accesibile. Nu este neapărat consensual și se poate face întotdeauna referire la bibliografia indicată în partea de jos a articolului.
Simbolul ▲ se referă imediat la partea superioară a arborelui filogenetic al ființelor vii. Semnul ► se referă la clasificarea filogenetică a grupului considerat. Orice nod al arborelui care poartă mai mult de două ramuri arată o nedeterminare a filogeniei interne a grupului considerat.
Obiceiurile tipografice ale botanicilor și zoologilor sunt diferite. Aici, pentru ușurința lecturii și unele grupuri actuale care se încadrează în cele două domenii tradiționale, numele taxonilor mai mari decât genul sunt scrise cu caractere drepte, numele genurilor sau speciilor în cursiv.
După un taxon , perioada de apariție a acestuia, atunci când este cunoscută, poate fi indicată prin următoarea legendă: ( Plé ): Pleistocen ; ( Pli ): Pliocen ; ( Mio ): Miocen ; ( Oli ): Oligocen ; ( Eoc ): Eocen ; ( Pal ): Paleocen ; ( Cre ): Cretacic ; ( Jur ): Jurassic ; ( Tri ): Triasic ; ( Per ): Permian ; ( Mașină ): Carbonifer ; ( Dev ): Devonian ; ( Sil ): Silurian ; ( Ord ): Ordovician ; ( Camb ): Cambrian ; ( Edi ): Ediacaran . Pentru mai multă precizie, dacă este posibil, ( - ): mai jos; ( ~ ): mediu; ( + ): superior.
Ciclul Leishmaniasis ( Leishmania sp. , Euglenozoa , Trypanosomatidae )
Trypanosoma cruzi crithidia ( Euglenozoa , Trypanosomatidae )
Principalul loc de dezbatere aici este, fără îndoială, locul ființelor eucariote fără mitocondrii : Metamonadine și alți parabazali . Analizele cladice le dau adesea ca fiind situate la baza arborelui eucariotelor, care a apărut înainte de endosimbioza care a dat naștere mitocondriilor. Dar se pare că genomul acestor protiști ține evidența acestei endosimbioze : mitocondriile s-ar fi pierdut ulterior. Aceasta este lecția învățată de cladogramele noastre de mai sus.
În plus, în cadrul chestionării endosimbiozei cloroplastelor (vezi discuția despre Archeplastide și, de asemenea, pe pagina Eucariote ), unii aduc Euglenae la plante și / sau Chromoalveoli .
Pentru filogenia parabazalienilor, am urmat Carpenter și Keeling, pentru care monocercomonadinele sunt gradul ancestral al tuturor parabazalienilor, iar hipermastiginele sunt polifiletice.
Relația exactă a Malawimonadinelor cu alți taxoni rămâne dezbătută.
Conform ultimelor analize efectuate de T. Cavalier-Smith , Excavatele sunt parafiletice, la baza arborelui eucariot, rădăcina situată între Euglénozoa și ceilalți taxoni (citiți aici ► ).
Acest comitet a propus o nouă clasificare, înlocuind-o pe cea a vechilor protiști și ținând cont de filogenii moleculare recente. Grupează eucariotele în șase grupuri cunoscute a fi monofiletice. Iată ce privește Excavata .
Clasificare propusă de Adl și colab. 2005 ▲ └─o Excavata (peut-être paraphylétique) ├─o Fornicata │ ├─o Eopharyngia │ │ ├─o Diplomonadida │ │ │ ├─o Hexamitinae │ │ │ ├─o Giardiinae │ │ │ └─? Enteromonadida │ │ └─o Retortamonadida │ └─o Carpediemonas ├─o Malawimonas ├─o Parabasalia │ ├─o Trichomonadida │ ├─o Cristamonadida │ ├─o Spirotrichonymphida │ └─o Trichonymphida ├─o Preaxostyla │ ├─o Oxymonadida │ └─o Trimastix ├─o Jakobida │ ├─o Jakoba │ ├─o Histionidae │ └─? Seculamonas ├─o Heterolobosea │ ├─o Vahlkampfiidae │ ├─o Gruberellidae │ ├─o Acrasidae │ └─? Macropharyngimonas, Pernina, Rosculus └─o Euglenozoa ├─o Euglenida │ ├─o Heteronematina (paraphylétique) │ ├─o Euglenea │ └─o Aphagea ├─o Diplonemea ├─o Kinetoplastea │ ├─o Prokinetoplastina │ ├─o Metakinetoplastina │ │ ├─o Neobodonida │ │ ├─o Parabodonida │ │ ├─o Eubodonida │ │ └─o Trypanosomatida │ └─? Bordnamonas, Cephalothamnium, Hemistasia └─? Calkinsia, Postgaardi: document utilizat ca sursă pentru acest articol.