Acronimul ATAC-seq provine din limba engleză Un ssay pentru T ransposase- A ccessible C hromatin cu highthroughput următoarele uencing . Aceasta este o tehnică utilizată în biologia moleculară pentru a caracteriza regiunile accesibile ale cromatinei, precum și într-o măsură mai mică poziționarea nucleozomală în jurul lor. Această metodă a fost descrisă pentru prima dată în 2013.
Principiul ATAC-seq se bazează pe modul de acțiune al transposazei Tn5 asupra ADN - ului genomic al probei. Transpozazele sunt enzime care catalizează mișcarea transpozonilor către alte părți ale genomului . Deși transpozazele naturale au un nivel scăzut de activitate, ATAC-seq folosește o transpozază mutantă hiperactivă.
Transpozoni sunt încorporate , de preferință , în regiunile genomice lipsite de nucleosomes ( regiuni-nucleozomilor liber în limba engleză). Astfel, o îmbogățire a secvențelor anumitor loci ai genomului indică absența nucleozomilor sau a altor interacțiuni ADN-proteină.
Avantajele ATAC-seq includ: