ADN satelit

ADN prin satelit este un tip de secvențe ADN repetate .

Compoziţie

ADN-ul satelit apare ca secvențe de ADN de până la câteva milioane de perechi de baze constând dintr-un număr mare de repetări ale unei secvențe mult mai mici ( unitatea de repetare ). Lungimea unității de repetare variază de la un tip de ADN satelit la altul, de la 5 perechi de baze pentru sateliții umani III până la 755 perechi de baze pentru sateliții găsiți în genomul plantelor.

Denumirea de „ADN satelit” provine din faptul că ADN-ul acestor secvențe, datorită naturii lor repetitive, are o compoziție nucleotidică puternic părtinitoare față de restul genomului; în consecință, sedimentează diferit prin ultracentrifugare (acumulare în tubul de centrifugare într-un loc care depinde exact de densitatea sa) și formează o bandă secundară, numită „satelit”, într-un gradient de clorură de cesiu .

Genomul uman

Genomul uman cuprinde aproximativ 7% ADN satelit.

ADN - ul satelit (denumit și ADN alfoid în engleză) constă din repetări ale unui model de 171 perechi de baze. Se găsește la nivelul centromerului tuturor cromozomilor , unde se întinde pe regiuni variind de la câteva sute de kilobaze la mai multe baze de date - numărul de repetiții și dimensiunea totală fiind variabile de la un cromozom la altul și de la un individ la altul. ADN-ul satelit contribuie la funcționarea centromerului, în special permițând recrutarea proteinei CENP-B ( proteina Centromeric B ) printr-un motiv conservat de 17 perechi de baze. Cu toate acestea, nu este esențial pentru buna funcționare a centromerului, neocentromerii complet funcționali putând fi observați pe regiuni genomice lipsite de α-sateliți.

ADN - ul satelit constă din repetări ale unui model de 68 de perechi de baze. Se răspândește pe regiuni de 50 până la 300 kilobaze pe brațele scurte ale cromozomilor acrocentrici (cromozomii 13, 14, 15, 21 și 22), pe pericentromerii cromozomilor 1, 3 și 9, precum și pe brațul lung al cromozomului Y.

ADN-ul satelit III constă în repetări ale unui motiv de 5 perechi de baze (GGAAT), care ocupă câteva sute de kilobaze în regiunea pericentromerică a majorității cromozomilor.

Genomul murin

ADN-ul satelit reprezintă aproximativ 3,5% din genomul murin și este asociat cu regiunile centromerice și pericentromerice ale tuturor cromozomilor. Există două tipuri:

Note și referințe

  1. Richard, Kerrest și Dujon 2008
  2. (în) SaulKit, "  Sedimentarea echilibrului în gradienții de densitate a preparatelor ADN din țesuturile animale  " , Journal of Molecular Biology , vol.  3, n o  6,decembrie 1961, p.  711–716 ( DOI  10.1016 / S0022-2836 (61) 80075-2 ).
  3. Sullivan, Schwartz și Willard 1996
  4. Karpen și Allshire 1997
  5. Waye și Willard 1989
  6. Meneveri și colab. 1993
  7. Consorțiul de secvențiere a genomului mouse-ului 2002
  8. Hörz și Altenburger 1981
  9. Wong și Rattner 1988

Vezi și tu

Bibliografie