Proiectul Blue Brain își propune să creeze un creier sintetic prin proces de inginerie inversă . Fondat în mai 2005 la Institutul Federal de Tehnologie Lausanne (EPFL) din Elveția , proiectul a studiat arhitectura și principiile funcționale ale creierului . Acesta a fost extins, în 2013, la Human Brain Project (HBP), condus și el de Henry Markram, dar finanțat în principal de UE. Blue Brain a fondat „Simulation Neuroscience”.
În 2002, Henry Markram s-a mutat la EPFL ; în 2005 , el a convins IBM să construiască o echipă internațională de 35 de informaticieni , matematicieni , biologi și fizicieni . În 2008 , cercetătorii au finalizat prima etapă a proiectului: au reușit să traducă proprietățile biologice ale unui fragment de creier de șobolan în date matematice ; au modelat 10.000 de neuroni virtuali conectați între ei prin 30 de milioane de sinapse și câțiva kilometri de fibre.
Această reconstrucție virtuală a unei coloane corticale , adică unitatea de bază a cortexului formată din mii de neuroni , a făcut posibilă identificarea a 240 de tipuri de neuroni.
În 2013, Markram credea că primul creier virtual de mamifere va fi disponibil în jurul anului 2018. „În fiecare an, există 35.000 de publicații de neuroștiințe. Un cercetător poate citi doar o sută: nu vom merge nicăieri fără un model care să integreze toate aceste cunoștințe fragmentate. "
Acest proiect, precum și Proiectul pentru creierul uman care derivă din acesta, sunt puternic criticate din diverse motive, inclusiv strategia științifică adoptată și costul ridicat al acestora. Lansat în 2013, HBP a trebuit să se confrunte cu o serie de critici, bazându-se printre altele pe lipsa de dovezi furnizate de Blue Brain . Cu toate acestea, în octombrie 2015, echipa Blue Brain Project a publicat un articol în Cell care descrie o simulare a unui creier de șobolan, care implică 30.000 de neuroni și 40 de milioane de sinapse - ceea ce nu a oprit criticile asupra irealismului global al HBP.
În decembrie 2018, cercetătorii din cadrul proiectului Blue Brain au anunțat digitalizarea primului atlas al creierului unui șoarece, intitulat „ Cell Atlas ”, o simulare 3D, interactivă și în continuă evoluție.
Blue Gene din Lausanne are 8000 de procesoare și efectuează 22,8 trilioane de operații pe secundă (22,8 teraflopi ). Puterea de calcul a următoarei generații de supercalculatoare va atinge un milion de miliarde de operații pe secundă, peste 450 m 2 și va necesita o putere electrică de 3 milioane de wați la un cost de 3 milioane de dolari pe an.
Proiectul a fost finanțat mai întâi de guvernul elvețian și apoi de subvenții și unele donații de la persoane private. EPFL a achiziționat calculatorul BlueGene de IBM actualizate din cauza calității sale prototip. Pentru a merge mai repede, IBM s-a angajat să livreze patru supercalculatoare din ce în ce mai puternice în decurs de zece ani la un „preț prietenos” .
Din 2015, Kathryn Hess a colaborat cu acest proiect folosind topologia algebrică pentru a studia problemele din neurologie și știința materialelor.