SCOP , Clasificarea structurală a proteinelor în limba engleză , este o bază de date de clasificare bioinformatică structurală a domeniilor de proteine din asemănări în secvența lor în aminoacizi și structura lor tridimensională. A fost creat în 1994 în centrul de inginerie a proteinelor (în) (EPC) și a fost întreținut din 2010 de către Laboratorul de biologie moleculară (în) (LMB), ambele situate în Cambridge , Marea Britanie . Lucrarea la SCOP, în principal manuală, a fost întreruptă la sfârșitul anului 2013 datorită accelerării exponențiale a publicațiilor de noi structuri proteice, iar cea mai recentă versiune disponibilă este 1,75, publicată înIunie 2009, care a organizat aproximativ 38.000 de intrări PDB într-un mod strict ierarhic.
În 2012, versiunea extinsă SCOPe a fost pusă online , dezvoltată la Universitatea din California la Berkeley , California , care extinde SCOP cu prelucrare automată a datelor pentru a face față exploziei din volumul de date care urmează să fie clasificate. Complet compatibil cu SCOP, a evoluat în 2014 odată cu reintroducerea procesării manuale pentru a garanta alocarea corectă a structurilor identificate, iar versiunea 2.06 SCOPe a clasificat 77.439 intrări PDB din aproape 120.000 intrări PDB disponibile în 2016.
Prototipul unei noi clasificări structurale a proteinelor, numită SCOP2 , a fost pus online, cu o abordare diferită, neierarhică , bazându-se în schimb pe o rețea care leagă superfamilii de proteine cu relații structurale și evolutive, cum ar fi permutări circulare. (En) sau fuziuni de domenii (ro) . În acest model, domeniile nu sunt definite de limite precise și fixe, ci mai degrabă de relațiile existente cu alte motive similare. Înfebruarie 2015, prototipul SCOP2 a clasificat 995 de intrări PDB.
Clasificarea SCOP depinde mai mult de deciziile umane decât de clasificarea semi-automată CATH (în) , principalul său concurent. Expertiza umană intervine pentru a evalua în ce măsură anumite proteine prezintă o relație evolutivă și, prin urmare, ar trebui plasate în aceeași superfamilie și în ce măsură asemănarea lor rezultă din constrângeri structurale, care le plasează apoi în aceeași clasă de pliere .