Republicanii, sub Primul Imperiu , au fost tăcuți de Napoleon I de-a lungul domniei sale.
În timpul Primului Imperiu al lui Napoleon I, republica este amalgamată cu Teroarea . Napoleon, care se află la originea acestui amalgam, are grijă să nu rupă radical cu tradiția republicană. În constituția Primului Imperiu, termenul republică este încă folosit, dar sub regimul napoleonian, natura sa se schimbă astfel încât republica este legată, într-un mod sistematic, de cea mai rea perioadă a sa, care între timp îi permite lui Napoleon să pretindă că fii moștenitor al părților bune ale Revoluției în timp ce rupi cu perioadele ei întunecate.
Din 1804, republicanii au fost numiți anarhiști în rapoartele poliției. Mai multe tentative de conspirație au fost, de asemenea, frustrate din 1807 de poliția napoleonică.
Republicanii sunt prezenți în mod deosebit în armată, dar sunt și numeroși printre foștii deputați ai Convenției , nume precum Carnot a căror familie va fi ardent republicană. La Fayette , deja la acea vreme, s-a impus ca lider natural al Partidului Republican, statut pe care îl va păstra până la moarte.