Amplificarea aleatorie a ADN - ului polimorfic , mai bine cunoscut sub numele de RAPD (pentru ADN polimorfic amplificat aleator ) este o tehnică de analiză a ADN - ului utilizat în biologia moleculară .
Aceasta este o reacție PCR în care segmentele de ADN amplificat nu sunt alese de experimentator, ci amplificate „la întâmplare”.
În această tehnică, experimentatorul creează mai mulți primeri scurți de secvență definită în mod arbitrar. Se procedează apoi la amplificarea PCR a ADN - ului genomic folosind primerii definiți mai sus.
Dacă acești primeri hibridizează cu ADN - ul testat, poate exista o amplificare a anumitor fragmente. Aceasta presupune că doi primeri hibridizează pe ambele părți ale unui segment ADN de o dimensiune compatibilă cu amplificarea (vezi articolul Reacția în lanț a polimerazei ). Prin urmare, amplificarea este aleatorie.
Analiza prin electroforeză a fragmentelor amplificate va da un profil particular, caracteristic ADN-ului inițial.
Un avantaj al tehnicii este că nu necesită cunoașterea prealabilă a ADN-ului țintă; primerii utilizați se vor hibridiza „aleator” în secvență, fără a ști exact unde.
Tehnica face posibilă compararea ADN-urilor sistemelor biologice pentru care sunt disponibile puține informații. ADN de la specii slab studiate sau ADN pentru care sunt disponibile puține secvențe.
Metoda nu face posibilă obținerea unei bănci de ADN a unui organism.
Una dintre limitările RAPD este că trebuie utilizată pe fragmente de ADN genomic „intacte”, rezultatele obținute cu fragmente de ADN degradate nu vor fi exploatabile. De asemenea, poate demonstra, fără a le cuantifica cu precizie, degradarea ADN-ului, de exemplu după expunerea unei celule sau a unui organism la un agent mutagen sau genotoxic .
RAPD este considerat a fi mai puțin eficient decât utilizarea metodelor de comparație care vizează ADN-uri specifice din specii precum STR sau VTR (repetare scurtă în tandem, vezi microsateliți )